雌二醇庚酸酯适用于因内源性雌激素缺乏所致的多种临床状况，包括原发性与继发性闭经、子宫发育不良、更年期综合征及相关症状。通过补充外源性雌激素，可有效缓解潮热、盗汗、情绪波动等更年期症状，同时改善泌尿生殖道萎缩，提升生活质量。对于有完整子宫者，建议联合孕激素使用，以降低子宫内膜增生及癌变风险。

此外可用于预防和管理雌激素缺乏相关的骨密度下降，尤其在绝经后骨质疏松高风险人群中具有重要临床价值。其长效注射特性有助于提高治疗依从性，减少每日口服带来的负担。

适应症的确认应基于完整的病史采集、体格检查及激素水平检测，避免经验性用药。