新研究结果表明,一种新的基因编码形式可以有效地矫正患有单基因疾病α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)患者的细胞突变,AATD是一种影响肝脏和肺部常见的遗传性疾病。这种碱基编码的新方法与其他编码方式不同,包括CRISPR,碱基编码不会导致DNA断裂,这有助于防止双链断裂、潜在的脱靶编码和细胞修复过程中不必要的突变。
在波士顿医学中心和波士顿大学再生医学中心(CReM)的Andrew Wilson博士和Rhiannon Werder博士的带领下,研究人员利用源自患者的肝细胞“iHeps”模拟了肝细胞的生物学特征。肝细胞是人体内α -1抗胰蛋白酶蛋白的主要生产者,同样具有代谢、内分泌和分泌功能。碱基编码技术矫正了导致AATD的Z突变,减少了该疾病对肝细胞的影响,证实了碱基编码在人类细胞中的成功。这些研究结果发表在《分子治疗》杂志上,有助于为未来的人体试验铺平道路。
Beam Therapeutics创建的碱基编码被应用于AATD患者的诱导多能干细胞(iPS细胞),然后再被应用于由iPS细胞衍生的肝细胞。
SERPINA1基因中的Z突变是导致AATD患者慢性、进展性肺和肝脏疾病的原因。在AATD患者中,突变的AAT蛋白发生错误折叠并形成蛋白聚集体,在肝细胞内积聚并造成损伤。
在这项研究中,研究人员首先从1例AATD患者的突变型(ZZ)诱导多能干细胞(iPSCs)开始。碱基编码过程完成后,对编码细胞的DNA进行测序,以确定SERPINA1基因是否被矫正。将带有1个(MZ)或2个复制(MM)矫正基因的克隆细胞群进行增殖,然后在25天的过程中分化生成肝细胞。对编码细胞的整个基因组进行测序后,没有证据表明碱基编码会造成基因突变,错误折叠和相关蛋白积聚在MZ细胞中部分得到了矫正,在MM正常细胞中全部得到了矫正。
利用突变型诱导多能干细胞(iPSCs)衍生的肝细胞重复这一过程。在不同的条件下,使用两种碱基编码来测试该过程的效率。在最佳条件下,约50%的突变基因被成功编码。然后对这些细胞进行分析,看它们是否仍然呈现“肝细胞”,并且与突变的ZZ细胞相比,观察编码后的细胞,疾病迹象是否更少。结果表明,碱基编码不会改变肝脏程序,肝细胞仍然在正常水平表达肝脏基因和蛋白质。
尽管强化治疗已经被证明可以缓解AATD患者的肺部疾病,但目前还没有可用于AATD相关肝病的治疗方法。
α -1抗胰蛋白酶缺乏症是碱基编码的主要靶点,可能是在人类研究中尝试使用碱基编码的早期疾病之一。其他疾病靶点包括视网膜疾病、遗传性酪氨酸血症、镰状细胞性贫血、早衰、囊性纤维化等。
这项研究的结果表明,未来的研究可能会探索碱基编码在其他静态细胞群中的作用。此外,最近有研究表明,碱基编码可以编码永生细胞系中的RNA和DNA,这值得进一步研究。
参考资料:
New form of gene editing efficient for treatment of AATD, liver and lung disease (medicalxpress.com)