疲劳、头痛、周围神经病变、脱发、皮疹、瘙痒、高血糖、恶心、呕吐、便秘、食欲不振、贫血、白细胞减少、中性粒细胞减少、血清天冬氨酸转氨酶升高、关节痛、四肢疼痛、发烧、高镁血症等等是康奈非尼主要的副作用，患者在接受该药品进行治疗前，应到医院做详细检查，并按照医生的诊疗建议用药。使用康奈非尼进行治疗可能导致胎儿伤害。
参考资料： FDA说明书更新于2025年3月12日，FDA说明书网址：https://www.accessdata.fda.gov/scripts/cder/daf/index.cfm?event=overview.process&ApplNo=210496
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